Morley war der Sohn eines Brauers und diente als Chorknabe in der Kathedrale von Norwich, wo er 1583 Organist wurde. In den Kirchenbüchern der Gemeinde St. Helen in Bishopsgate ist er ebenfalls als Musiker verzeichnet. 1589 wurde er Organist an der St. Paul’s Cathedral, nachdem er 1588 in Oxford einen Abschluss in Musik erworben hatte. Schließlich wurde er 1592 zum Gentleman der Chapel Royal ernannt. 1596 erhielt er von Königin Elisabeth das Monopol auf den Druck von Noten, das zuvor William Byrd gehört hatte. Insgesamt veröffentlichte er neun Madrigalsammlungen, das Genre, für das er bis heute bekannt ist: Morley gilt als virtuoser Komponist leichter polyphoner Lieder.
